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洗滌在 ELISA 過程中雖不是一個反應步驟，但卻也決定著實驗的成敗。 ELSIA 就是靠洗滌來達到分離游離的和結合的酶標記物的目的。通過洗滌以清除殘留在板孔中沒能與固相抗原或抗體結合的物質，以及在反應過程中非特異性地吸附于固相載體的干擾物質。聚苯乙烯等塑料對蛋白質的吸附是普遍性的，而在洗滌時又應把這種非特異性吸附的干擾物質洗滌下來。可以說在 ELISA 操作中，洗滌是最主要的關鍵技術，應引起操作者的高度重視，操作者應嚴格按要求洗滌，不得馬虎。   　　洗滌的方式除某些 ELISA 儀器配有特殊的自動洗滌儀外，手工操作有浸泡式和流水沖洗式兩種，過程如下：   　　（ 1 ）浸泡式   a. 吸干或甩干孔內反應液； b. 用洗滌液過洗一遍（將洗滌液注滿板孔后，即甩去）； c. 浸泡，即將洗滌液注滿板孔，放置 1-2 分鐘，間歇搖動，浸泡時間不可隨意縮短； d. 吸干孔內液體。吸干應徹底，可用水泵或真空泵抽吸，也可甩去液體后在清潔毛巾或吸水紙上拍干； e. 重復操作 c 和 d ，洗滌 3-4 次（或按說明規(guī)定）。在間接法中如本底較高，可增加洗滌次數或延長浸泡時間。   　　微量滴定板多采用浸泡式洗滌法。洗滌液多為含非離子型洗滌劑的中性緩沖液。聚苯乙烯載體與蛋白質的結合是疏水性的，非離子型洗滌劑既含疏水基團，也含親水基團，其疏水基團與蛋白質的疏水基團借疏水鍵結合，從而削弱蛋白質與固相載體的結合，并借助于親水基團和水分子的結合作用，使蛋白質回復到水溶液狀態(tài)，從而脫離固相載體。洗滌液中的非離子型洗滌劑一般是吐溫 20 ，其濃度可在 0.05%-0.2% 之間，高于 0.2% 時，可使包被在固相上的抗原或抗體解吸附而減低試驗的靈敏度。   　　（ 2 ）流水沖洗式 流水沖洗法最初用于小珠載體的洗滌，洗滌液僅為蒸餾水甚至可用自來水。洗滌時附接一特殊裝置，使小珠在流水沖擊下不斷地滾動淋洗，持續(xù)沖洗 2 分鐘后，吸干液體，再用蒸餾水浸泡 2 分鐘，吸干即可。浸泡式猶如盆浴，流水沖洗式則好比淋浴，其洗滌效果更為徹底，且也簡便、快速。已有實驗表明，流水沖洗式同樣也適用于微量滴定板的洗滌。洗滌時設法加大水流量或加大水壓，讓水流沖擊板孔表面，洗滌效果更佳。

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